无缝克隆加样计算器

同源重组依据:诺唯赞 C117 说明书 V24.1 第 07 页;经验比例依据:NEB NEBuilder HiFi 官方手册;T4 连接依据:NEB M0202 官方方案(详见页尾"计算规则与出处")
模式 A · 严格按 C117 说明书
单片段 1:2(0.03/0.06 pmol);多片段 1:1(各 0.03 pmol);限 10–100 ng;片段长于载体自动互换公式
模式 B · 经验比例(自动)
1–2 个片段自动按 2×,≥3 个自动 1:1;<200 bp 片段自动 5×(NEB 经典规则)
模式 C · 传统酶切连接(T4)
载体:片段 = 1:3 摩尔比(NEB M0202 经典),20 μl 体系,16 ℃ 过夜
角色 片段名称 长度 (bp) 浓度 (ng/μl)
组分 加样体积 (μl) 用量 (ng) 摩尔量 (pmol) 摩尔比 提示
计算规则与出处(含官方链接)
模式 A · 严格按 C117 说明书(V24.1 第 07 页「07-1 重组反应」):
  • 体系 10 μl:2 × CE Mix V3 5 μl + 载体 X μl + 片段 Y₁…Yₙ μl + ddH₂O 补足。
  • 单片段:载体 0.02 × bp ng(0.03 pmol),片段 0.04 × bp ng(0.06 pmol),摩尔比 1:2;片段长于载体时两者公式互换(仅单片段适用)。
  • 多片段(n ≥ 2):载体与每个片段各 0.02 × bp ng(0.03 pmol),摩尔比 1:1。
  • 投入量限 10–100 ng(超范围取边界);单组分加样 ≥1 μl(不足需稀释);DNA 总体积 >5 μl 时等比降量;兼容范围 0.003–0.25 pmol。
模式 B · 经验比例(NEB NEBuilder HiFi 官方规则,同源组装最经典默认): 模式 C · 传统酶切连接(T4 DNA Ligase,NEB M0202 经典方案):
  • 20 μl 体系:10 × 连接 Buffer 2 μl + 载体 DNA 50 ng + 插入片段(载体:片段 = 1:3 摩尔比)+ T4 DNA Ligase 1 μl(最后加)+ ddH₂O 补足。
  • 黏末端:16 ℃ 过夜或室温 10 min;平末端:16 ℃ 过夜或室温 2 h;65 ℃ 10 min 热灭活;取 1–5 μl 转化 50 μl 感受态。
  • 出处:Ligation Protocol with T4 DNA Ligase (NEB M0202)。
摩尔换算:ng = pmol × bp × 0.66(dsDNA 660 g/mol/bp;NEB 用 650,差异 <2%,可忽略)。