无缝克隆加样计算器
同源重组依据:诺唯赞 C117 说明书 V24.1 第 07 页;经验比例依据:NEB NEBuilder HiFi 官方手册;T4 连接依据:NEB M0202 官方方案(详见页尾"计算规则与出处")
模式 A · 严格按 C117 说明书
单片段 1:2(0.03/0.06 pmol);多片段 1:1(各 0.03 pmol);限 10–100 ng;片段长于载体自动互换公式
模式 B · 经验比例(自动)
1–2 个片段自动按 2×,≥3 个自动 1:1;<200 bp 片段自动 5×(NEB 经典规则)
模式 C · 传统酶切连接(T4)
载体:片段 = 1:3 摩尔比(NEB M0202 经典),20 μl 体系,16 ℃ 过夜
反应体系
10 μl(说明书)
20 μl
5 μl
插入片段数
载体基准
固定 50 ng(NEB 推荐 50–100 ng)
固定 100 ng
0.03 pmol
0.05 pmol
反应体系
20 μl(NEB 经典)
10 μl
载体用量
ng
载体:片段
1:1
1:2
1:3(NEB 经典)
1:5
1:10
T4 连接酶
μl
载入示例
清空
角色
片段名称
长度 (bp)
浓度 (ng/μl)
计算加样体积
组分
加样体积 (μl)
用量 (ng)
摩尔量 (pmol)
摩尔比
提示
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计算规则与出处(含官方链接)
模式 A · 严格按 C117 说明书(V24.1 第 07 页「07-1 重组反应」):
体系 10 μl:2 × CE Mix V3 5 μl + 载体 X μl + 片段 Y₁…Yₙ μl + ddH₂O 补足。
单片段:载体
0.02 × bp
ng(0.03 pmol),片段
0.04 × bp
ng(0.06 pmol),摩尔比 1:2;
片段长于载体时两者公式互换
(仅单片段适用)。
多片段(n ≥ 2):载体与每个片段各
0.02 × bp
ng(0.03 pmol),摩尔比 1:1。
投入量限 10–100 ng(超范围取边界);单组分加样 ≥1 μl(不足需稀释);DNA 总体积 >5 μl 时等比降量;兼容范围 0.003–0.25 pmol。
模式 B · 经验比例(NEB NEBuilder HiFi 官方规则,同源组装最经典默认):
载体基准默认 50 ng(NEB 推荐 50–100 ng),可切换为 100 ng / 0.03 pmol / 0.05 pmol。
1–2 个插入片段:每片段按载体 2× 摩尔量
(vector:insert = 1:2);
≥3 个插入片段:全部 1:1 等摩尔
。
<200 bp 的片段自动按 5× 摩尔量
("Use 5-fold molar excess of any insert(s) less than 200 bp")。
出处:
NEBuilder HiFi DNA Assembly Reaction Protocol (NEB)
;
NEBuilder HiFi 手册 PDF (E2621/E5520)
。
模式 C · 传统酶切连接(T4 DNA Ligase,NEB M0202 经典方案):
20 μl 体系:10 × 连接 Buffer 2 μl + 载体 DNA 50 ng + 插入片段(
载体:片段 = 1:3 摩尔比
)+ T4 DNA Ligase 1 μl(最后加)+ ddH₂O 补足。
黏末端:16 ℃ 过夜或室温 10 min;平末端:16 ℃ 过夜或室温 2 h;65 ℃ 10 min 热灭活;取 1–5 μl 转化 50 μl 感受态。
出处:
Ligation Protocol with T4 DNA Ligase (NEB M0202)
。
摩尔换算:
ng = pmol × bp × 0.66
(dsDNA 660 g/mol/bp;NEB 用 650,差异 <2%,可忽略)。